โรงเรียนบางลี่วิทยา ตั้งอยู่ที่อำเภอสองพี่น้อง จังหวัดสุพรรณบุรี ก่อตั้งขึ้นเมื่อปีการศึกษา 2499 เดิมมีชื่อว่า “โรงเรียนบางลี่ (เทพสุธาประชาสรรค์)” เปิดทำการสอนในระดับมัธยมศึกษาตอนต้น สังกัดกองการศึกษาพิเศษ กรมสามัญศึกษา กระทรวงศึกษาธิการ ในที่ดินของนายเป๊ะ เทพสุธา มีจำนวนพื้นที่ 10 ไร่ 2 งาน 68 ตารางวา ต่อมามีการเปลี่ยนแปลงหลักสูตรและแผนการศึกษาแห่งชาติ ปีพุทธศักราช 2503 จึงเปลี่ยนเป็นโรงเรียนประถมศึกษาตอนปลาย สังกัดกองการศึกษาพิเศษ กรมสามัญศึกษา กระทรวงศึกษาธิการเช่นเดิม ต่อมาโรงเรียนประสบปัญหาเด็กนักเรียนน้อยลง เนื่องมาจากโรงเรียนประถมศึกษาสังกัดองค์การบริหารส่วนจังหวัด (โรงเรียนสังกัดสำนักงานประถมศึกษาแห่งชาติ) เปิดทำการสอนระดับประถมศึกษาตอนปลายขึ้นในทุกโรงเรียน และโรงเรียนเดิมตั้งอยู่ในที่ลุ่มน้ำท่วมทุกๆปี ทำให้การสัญจรไปมาของนักเรียนมีความยากลำบาก ดังนั้นกระทรวงศึกษาธิการ จึงประกาศยุบเลิกโรงเรียนบางลี่ (เทพสุธาประชาสรรค์) และได้ประกาศจัดตั้งโรงเรียนมัธยมศึกษาตอนต้นขึ้น ใช้ชื่อว่า โรงเรียนบางลี่วิทยา สังกัดกองการมัธยมศึกษา กรมสามัญศึกษา กระทรวงศึกษาธิการ เมื่อวันที่ 2 มิถุนายน 2518 อนุมัติแผนการจัดชั้นเรียนเป็น 3-2-0 โดยให้ใช้สถานที่และอุปกรณ์ของโรงเรียนเดิม และให้โอนทรัพย์สินข้าราชการและลูกจ้างประจำไปยังสังกัดใหม่ทั้งหมด แต่เนื่องจากบริเวณที่ดินโรงเรียนเดิมมีน้อยเกินไปไม่เพียงพอกับการขยายตัว จึงได้ย้ายมาตั้งอยู่บริเวณตรงข้ามกับโรงพยาบาลสมเด็จพระสังฆราชองค์ที่ 17 โดย จ.ส.ต.อั๋น และนางละมัย สูติวงษ์ มีจิตศรัทธามอบที่ดินจำนวน 22 ไร่ 80 ตารางวา นางกิมเน้ย เหลืองวิไล มีจิตศรัทธามอบที่ดินจำนวน 8 ไร่ 1 งาน 40 ตารางวา คณะกรรมศึกษาของโรงเรียนร่วมกันจัดหาเงินซื้อที่ดินมอบให้อีก 10 ไร่ และที่สำรองสาธารณะ 9 ไร่ 32.4 ตารางวา ปัจจุบันโรงเรียนบางลี่วิทยามีที่ดินทั้งสิ้น 49 ไร่ 2 งาน 52.4 ตารางวา เปิดทำการเรียนการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1-6 สังกัดเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาสุพรรณบุรี สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ